Orașul Milișăuți face parte din următoarele Asociații:

  1. Grupul de Acțiune Locală ”Cetatea Bucovinei”, împreună cu orașul Cajvana și comunele Șcheia, Ilișești, Moara, Bălăceana, Todirești, Stroiești, Pârteștii de Jos, Dărmănești, Botoșana și Comănești
  2. Asociația de Dezvoltare Intercomunitară ”Zona Metropolitană Rădăuți”, împreună cu municipiul Rădăuți și comunele Dornești, Frătăuții Vechi, Horodnic de Jos, Horodnic de Sus, Satu Mare și Volovăț.